Sehr selten in offenen, südexponierten Kalk-Magerrasen. Der Schmalblättrige Lein kommt nur in isolierten Kleinpopulationen vor und ist stark rückläufig (Bönsel & al. 2021). Nach Dosch & Scriba (1873) bestanden Vorkommen entlang der Bergstraße, zum Beispiel bei Bickenbach und Seeheim; hier ist die Pflanze offenbar mittlerweile erloschen (Bönsel & al. 2021.
Werra-Meißner: Hohes Rod b. Hermannrode (Pfeiffer 1847, G. Dersch 1974 nach Baier & al. 2002); Galgenberg bei Gertenbach (Grimme 1958, 1961 Nieschalk in FR, Baier & al. 2002); Albungen (1960 J. Dörjes in FR).
Fulda: Hofaschenbach (Lange 1994, 1998 K. Baumann 98/41 in FR; Mittelaschenbach, 2019 Bönsel & al. 2021).
Main-Kinzig: auf den Weinbergen bei Bischofsheim (Russ 1868); Weinberg von Hohenzell (1973 Korneck 1983); Herolzer Giebel (Wigand & Meigen 1891, 1954 A. Seibig in FR, Ganzert & al. 1983; nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021); Weinberg Ahlersbach (1973 D. Korneck Mitteilung; Zeh 1989; östlich Ahlersbach, nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021).
Rheingau-Taunus-Kreis: Bienenberg bei Geisenheim (Werckmeister 1960, 2002 B. Hilgendorf nach Streitz 2005); Johannisberg bei Geisenheim (L. Fuckel in FR; Sommerberg nordwestlich Geisenheim; nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021); Mückenkopf bei Lorch (1965 Grossmann in FR, Zischka & Zischka 1967, 2003 B. Hilgendorf nach Streitz 2005; nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021); Niederwald bei Rüdesheim (Arnoldi nach Rudio 1851); Steinbrüche bei Jugendherberge Rüdesheim (1966 Heseler nach Großmann 1976; nordwestlich Rüdesheim, nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021); Oestrich (L. Fuckel in FR).
Main-Taunus: Falkenberg zw. Hochheim u. Flörsheim (ca. 1730 J. C. Senckenberg nach Spilger 1941; 1950 Neubaur 1952; Standort zerstört, Breyer 1988).
Frankfurt am Main: Lerchenberg (1727 J. C. Senckenberg nach Spilger 1941, Lerchesberg, 1883-1885, M. Dürer (Feldbücher in FR, erloschen Spilger 1941); bei Bergen (Becker 1827; 1883-1885, M. Dürer (Feldbücher in FR); bei Seckbach (Becker 1827; 1883-1885, M. Dürer (Feldbücher in FR).
Bergstraße: Bergstraße bei Bickenbach (Dosch & Scriba 1873); Bergstraße bei Seeheim (Dosch & Scriba 1873); Hemsberg bei Zell (1955 D. Korneck Mitteilung; Buttler 2002; nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021); Luciberg bei Zwingenberg (1956 Korneck 1984; nicht mehr, 2019 Bönsel & al. 2021).